Тысячу лет назад Землю уничтожила раса Гауна - гигантские практически неуязвимые пришельцы. "Сидония" - один из межзвездных кораблей-городов, на которых выжившие люди странствуют по космосу и ищут новый дом. Одновременно жителям "Сидонии" приходится отбиваться от нападений Гауна - для этого созданы специальные роботы, Стражи.Нагатэ Таникадзэ вырос на заброшенных нижних уровнях "Сидонии". Случайно оказавшись наверху, он был обнаружен военными, которые заметили в юноше талант к управлению боевыми механизмами и назначили его пилотировать "Цугумори" - Стража старой модели. Теперь Нагатэ и его собратьям-пилотам предстоит выжить в почти безнадежной войне против Гауна.
Tysjachu let nazad Zemlju unichtozhila rasa Gauna - gigantskie prakticheski neujazvimye prisheltsy. "Sidonija" - odin iz mezhzvezdnykh korablej-gorodov, na kotorykh vyzhivshie ljudi stranstvujut po kosmosu i ischut novyj dom. Odnovremenno zhiteljam "Sidonii" prikhoditsja otbivatsja ot napadenij Gauna - dlja etogo sozdany spetsialnye roboty, Strazhi.Nagate Tanikadze vyros na zabroshennykh nizhnikh urovnjakh "Sidonii". Sluchajno okazavshis naverkhu, on byl obnaruzhen voennymi, kotorye zametili v junoshe talant k upravleniju boevymi mekhanizmami i naznachili ego pilotirovat "Tsugumori" - Strazha staroj modeli. Teper Nagate i ego sobratjam-pilotam predstoit vyzhit v pochti beznadezhnoj vojne protiv Gauna.